Dokumen keanekaragaman hayati merupakan dokumen lingkungan hidup yang menginventarisasi flora dan fauna (herpetofauna) yang berada di daerah tertentu. Dinas Lingkungan Hidup Kabupaten Magetan telah menjalin kerjasama untuk menginventarisasi keanekaragaman hayati sudah 2 tahun terakhir.